تجسم پیچ و خمهای DNA و ماکرومولکولهای مرموزی چون پروتئینها و درک ویژگیهای وابسته به این ساختارها، برای انسان بسیار مشکل است. در این زمینه تصاویر سه بعدی بسیار راهگشا و پر فایده هستند. تصاویر و انیمیشنهای زیادی به همراه نرمافزارهای با ارزشی که این تصاویر را نمایش دهند به وجود آمدهاند که در این فصل به نمونهای از آنها توجه خواهیم کرد. پژوهشگران به روشهای مختلفی از جمله تابش اشعه ایکس ساختار سه بعدی پروتئینها را مورد بررسی قرار میدهند. نتایج حاصل از این پرتونگاریها، اطلاعاتی است که در به تصویر کشیدن این ساختارها مورد نیاز است. یک گروه از پایگاه دادهها به نام Structure توسط NCBI تدارک دیده شده است که اطلاعات مربوط به ساختار سه بعدی پروتئینها را در خود نگه میدارد. این گروه شامل مواردزیراست ادامه مطلب ...
درک زبان خاموش اما جذاب سلولهای زنده، تلاش بیولوژی مولکولی مدرن است. از یک الفبای ساده چهار حرفی (آدنین، گوانین، سیتوزین، تیمین) دستورالعمل فرآیندهای حیاتی شکل می گیرد که پیچیده ترین بیان و گفتار آنها "انسان" است. حجم فوق العاده زیاد داده های مولکولی و الگوهای مبهم و مرموز آنها ما را بر آن داشته است تا به نیاز مطلق به پایگاه های داده کامپیوتری و ابزارهای تحلیل دادهها پی ببریم. تلاش و مبارزه ما یافتن روش های جدید، جهت مدیریت این دادهها حجیم و پیچیده است و نیز فراهم کردن بستری جهت دسترسی به ابزارهای کامپیوتری و تحلیل داده هاست تا میراث ژنتیکی خود را بیش تر درک کنیم و نقش آن را در سلامت و بیماریها بیابیم . ادامه مطلب ...
miRBase: http://www.mirbase.org
بانک اطلاعاتی
miRBaseبانکی قابل جستجو از توالیهای miRNA منتشر شده و موقعیت یابی شده
می باشد. هر ورودی جدید در بانک توالی miRBase نشان دهنده یک قسمت سنجاق
سری پیشگویی شده از رونوشت miRNA (تحت عنوان mir) به همراه اطلاعات مکانی و
توالی miRNA بالغ (تحت عنوان miR) می باشد. هر دو توالی سنجاق سری و بالغ
جهت جستجو و بررسی قابل دسترس می باشند، ورودیها همچنین می توانند به کمک
نام، کلمه کلیدی، منابع و موقعیت ژنومی دستیابی شوند. تمامی اطلاعات مربوط
به توالی ها و موقعیت ژنومی آنها نیز قابل دانلود شدن هستند.
ادامه مطلب ...