اندونوکلئاز ها

 

آنزیمهای اندوکلئاز به دو دسته اختصاصی و غیر اختصاصی تقسیم می‌شوند. دسته اول توالی ویژه‌ای را شناسایی کرده و برش می‌دهند که اصطلاحا اندونوکلئازهای محدودکننده نامیده می‌شوند. این نوع آنزیمها از اهمیت ویژه‌ای در کلونینگ DNA بر خوردار می‌باشند. دسته دوم از این آنزیمها به طور تصادفی اسیدهای نوکلئیک را برش می‌دهند. در زیر به معرفی تعدادی از آنزیمهای اندونوکلئاز غیر اختصاصی  پرداخته می‌شود. 

ایزوزیم ها

ایزوزیمها (همچنین به عنوان ایزوآنزیم نیز شناخته میشوند) آنزیمهایی هستند که در ترکیب اسیدهای آمینه تفاوت دارند اما واکنش یکسان شیمیایی را تسریع میکنند. این آنزیم ها معمولا پارامترهای جنبشی متفاوت یا خصوصیت های منظم متفاوت را نشان میدهند (مثل ارزشهای متفاوت در km ). 

ساختار سوم DNA (بخش پایانی)

توپولوژی مولکول DNA:

مکان شناسی یا توپولوژی DNA با استفاده از سه ویژگی Linking Number ،Twist و Write بیان می شود 

ساختار سوم DNA (بخش اول)

ساختار اول DNA شامل ترادف نوکلئوتیدی، ساختار دوم شامل مارپیچ دو رشته ای و ساختار سوم ساختار فراپیچیده یا سوپرکویل است. ساختار سوم در اثر ایجاد فشار، اتصال برخی از پروتئین ها از جمله توپوایزومرها، هیستونها، داروها و شرایط خاص دیگر بوجود می آید. 

اصطلاحات رایج در علم ژنتیک

 اگر چه درک اصول ژنتیک، ژنتیک پزشکی و انسانی ، نسبتا آسان می‌باشد، اصطلاحات نامانوس ممکن است در ابتدا باعث شوند که این موضوع دور از دسترس به نظر برسد. برای کمک به حل این مشکل، برخی اصطلاحات به همراه توضیح آن آورده شده است. 

خاموشی ژن (Gene Silencing)

خاموشی ژن به پدیدۀ کاهش بیان و یا توقف کامل یک ژن ( توالی DNA و یا توالی RNA ) که قبلا بیان شده گفته می شود.

 بطور کلی پدیدۀ خاموشی ژن در دو سطح قابل بررسی است :

خاموشی ژن در مرحلۀ رونویسی

(Transcriptional Gene Silencing = TGS)

خاموشی ژن پس از رونویسی                                          

(Post Transcriptional Gene Silencing = PTGS)

  در نتیجه خاموشی ژن در گیاهان می تواند نتیجه جلوگیری از رونویسی ژن و یا تخریب mRNA رونویسی شده باشد.  

اندامک اصلی دخیل در خاموشی ژن کشف شد

 

مولکول های RNA ساخته شده از روی DNA بدلیل نقشی که در تولید پروتئین دارند بخوبی شناخته شده اند. میکروRNA ها، توالی های کوچک نوکلئوتیدی از جنس RNA هستند (~22 bp) که در گیاهان و جانوران یافت می شوند، پروتئینی کد نمی کنند اما در تنظیم ژن ها نقش دارند و تقریبا" در تمام فرآیندهای بیولوژیکی، از نمو تا واکنش به استرس اثر می گذارند. 

کاوشگرها (Probes)

کاوشگر در واقع چیزی نیست مگر یک قطعه اسید نوکلئیک که پژوهشگر در نظر دارد از وجود آن در یک قطعه ژنوم یا توده DNA مورد مطالعه اطلاع حاصل کرده و یا وقایع درون و پیرامون آن را بررسی کند. این قطعه اسید نوکلئیک در بیشتر موارد یک قطعه DNA است که ممکن است ردیف آن شناخته شده یا مجهول باشد 

پروتئینی به شکل عنکبوت

 پروتئین C4BP در شکل فضائی خود با "8بازو" شبیه به یک عنکبوت است.

ساختار "بدن عنکبوتی" اخیرا توسط محققان از مرکز هلمهولتز برای تحقیقات عفونی Braunschweig در HZI  و دانشگاه فنی Darmstadt با جزئیات کامل تشریح شده است. این امر داشنمندان را به سوی ایده های غیرمتعارف سوق داد. این پروتئین احتمالا بعنوان یک داربست برای انتقال مواد فعال داروئی بخصوص مولکول های زیستی مناسب می باشد. 

پروتئین‌های ضد یخ

 فعالیت ضد انجمادی تاکنون در بسیاری از موجودات، از ماهی­های آزاد تا حشرات، گیاهان، باکتری­ها و قارچ­ها که با دماهای پایین مواجه هستند مشاهده شده است. نقش پروتئین­ های محافظت کننده از سرما حفاظت از پروتئین­ های درون سلولی و غشاء در طی فرآیند انجماد - ذوب است. پروتئین­های ضد انجماد یا ضد یخ Antifreeze proteins, AFPs توسط موجوداتی که در آب و هوای سرد زندگی می کنند، برای تحمل سرما و اجتناب از انجماد تولید می­شوند. پروتئین­ های اخیر با اتصال به بلور یخ از تشکیل آن جلوگیری می­کنند.