پروتئین های اینتگرال غشایی بوده و حاوی یک گروه پروستتیک آهن پروتوپورفیرین 9 (هم) هستند. آهن موجود در سیتوکروم های P450، قابلیت تشکیل شش پیوند، چهار تا با چهار اتم نیتروژن پیرول حلقه پورفیرینی و دو تا با لیگاندهای محوری را دارد. یکی از لیگاندهای محوری (که پروگزیمال) نام دارد، گروه سولفیدریل ریشه سیستئین است که در سمت انتهای کربوکسیل مولکول سیتوکروم P450 قرار گرفته و لیگاند دیگر (دیستال) می تواند آزاد بوده و یا توسط اکسیژن، CO، NO، آب و یا سایر لیگاندها اشغال گردد.