کشف پروتئینی که به سلول های بنیادی مغز اجازه ساخت نورون های جدید را می دهد

گروهی از محققان بخش نوروبیولوژی مولکولی دانشگاه والنسیا اسپانیا در تحقیقاتی برنامه معمولی فعال سازی سلول های بنیادی مغز بالغ برای تولید نورون های جدید در طول تمام عمر را کشف کردند. 

راهبرد جدید محققان برای درمان سرطان مثانه

محققان راهبرد جدیدی برای درمان سرطان مثانه ارائه کردند که در آن نانومیله‌های طلا به بدن تزریق می‌شود؛ این نانومیله‌ها قادرند به پروتئین‌های ویژه‌ای که توسط سلول سرطانی ایجاد می‌شود، متصل شوند و با تابش لیزر، گرم شده و سلول سرطانی را از بین ببرند. 

دارورسانی به سلول‌های سرطانی با ویروس پستچی

پژوهشگران دانشگاه رایس موفق به طراحی نوعی ویروس شدند که می‌تواند مانند یک صندوق پست عمل کند؛ این صندوق دو کلید ویژه دارد که با استفاده از آن‌ها می‌توان محتویات دارویی موجود در ویروس را رهاسازی کرد. 

بازخوانى داستان کشف مارپیچ دوتایى

در میان یافته‌هاى علمى زیست‌شناسى، به کم‌تر یافته‌اى بر می‌خوردیم که به اندازه‌ى یافته‌ى جیمز واتسون و فرانسیس کریک، یعنى کشف ساختمان سه بعدى DNA معروف باشد. این کشف نتیجه‌ى کار پژوهشى آنان به تنهایى نبود، بلکه حاصل هم‌ اندیشى و کنار هم چیدن یافته‌هاى پژوهشگران دیگرى بود که به باور برخى از دانشمندان، نقش آنان در روشن شدن ساختمان سه بعدى DNA ، از واستون و کریک پررنگ‌تر بود. 

معرفی پایگاه های داده بیوانفورماتیکی (OMIM)

این پایگاه داده را که مربوط به اطلاعات پزشکی است می توان از بین دیتابیس های NCBI باز کرد. 

معرفی پایگاه های داده بیوانفورماتیکی (BLAST)

 

آنچه در برنامه BLAST انجام می شود پیدا کردن جفت قطعاتی مشابهی از توالی است که امتیاز همردیفی آن ها از یک حد آستانه مشخصی بالاتر باشد. این قطعات (HSPs (high-scoring segment pairs نامیده می شوند. برای این کار برنامه BLAST از روش Dynamic Programming استفاده می‌کند. 

معرفی پایگاه های داده بیوانفورماتیکی (MMDB و آموزش کار با Cn3D )

تجسم پیچ‌ و خم‌های DNA و ماکرومولکولهای مرموزی چون پروتئین‌ها و درک ویژگی‌های وابسته به این ساختارها، برای انسان بسیار مشکل است. در این زمینه تصاویر سه بعدی بسیار راهگشا و پر فایده هستند. تصاویر و انیمیشن‌های زیادی به همراه نرم‌افزارهای با ارزشی که این تصاویر را نمایش دهند به وجود آمده‌اند که در این فصل به نمونه‌ای از آنها توجه خواهیم کرد. پژوهشگران به روش‌های مختلفی از جمله تابش اشعه ایکس ساختار سه بعدی پروتئین‌ها را مورد بررسی قرار می‌دهند. نتایج حاصل از این پرتونگاری‌ها، اطلاعاتی است که در به تصویر کشیدن این ساختارها مورد نیاز است. یک گروه از پایگاه داده‌ها به نام Structure توسط NCBI تدارک دیده شده است که اطلاعات مربوط به ساختار سه بعدی پروتئین‌ها را در خود نگه می‌دارد. این گروه شامل مواردزیراست 

معرفی پایگاه های داده بیوانفورماتیکی (Nucleotide)

از منوی جست و جوی NCBI دیتا بیس Nucleotide را انتخاب می کنیم: 

معرفی پایگاه های داده بیوانفورماتیکی (موتور جستجوی Entrez)

یکی از پر استفاده ترین ابزارهای جست و جوی اطلاعات بیولوژی، موتور جست و جوی Entrez است که NCBI آن را ایجاد کرده است. این موتور جست و جو قادر است به طور همزمان، بانک های اطلاعاتیMed Pub، توالی های نوکلئوتیدی(GenBank)، توالی های پروتئینی (protein)، ساختمان پروتئین‌ها(Structure)، ژنوم کامل انسان و بعضی حیوانات، تاکسونومی، پایگاه داده بیماری‌های ژنتیکی (OMIM) و بسیاری موارد دیگر را جست و جو کند 

معرفی پایگاه های داده بیوانفورماتیکی (مقدمه)

درک زبان خاموش اما جذاب سلولهای زنده، تلاش بیولوژی مولکولی مدرن است. از یک الفبای ساده چهار حرفی (آدنین، گوانین، سیتوزین، تیمین) دستورالعمل فرآیندهای حیاتی شکل می گیرد که پیچیده ترین بیان و گفتار آن‌ها "انسان" است. حجم فوق العاده زیاد داده های مولکولی و الگوهای مبهم و مرموز آن‌ها ما را بر آن داشته است تا به نیاز مطلق به پایگاه های داده کامپیوتری و ابزارهای تحلیل داده‌ها پی ببریم. تلاش و مبارزه ما یافتن روش های جدید، جهت مدیریت این داده‌ها حجیم و پیچیده است و نیز فراهم کردن بستری جهت دسترسی به ابزارهای کامپیوتری و تحلیل داده هاست تا میراث ژنتیکی خود را بیش تر درک کنیم و نقش آن را در سلامت و بیماری‌ها بیابیم  .