آموزش تصویری طراحی پرایمر با نرم افزار الیگو (Oligo)

اولین قدم در طراحی یک پرایمر یافتن توالی ژن مورد نظر است.می توان با استفاده از پایگاه داده NCBI و در Nucleotide با جست و جوی نام ژن در این پایگاه توالی ژن را به دست آورد. (برای آموزش جستجو در دیتابیس ها به مقالات بیوانفورماتیک در همین وبلاگ مراجعه کنید). 

آموزش کار با نرم افزار CLC (یافتن توالی های مشترک بین گونه ها)

نرم افزار CLC کاربردهای فراوانی در زیست شناسی مولکولی دارد.
برای دانلود نرم افزار می توانید به اینجا رجوع کنید.
در این مقاله استفاده از این نرم افزار برای یافتن توالی های مشترک در یک ژن مشترک در چند گونه بیان شده است. 

ژن های کاذب: بیومارکرهایی برای سرطان

ژن های کاذب که فاقد عملکردند و به نظر می رسد کاربردی ندارند خویشاوندان ژن هایی هستند که توانایی خود را جهت کد کردن پروتئین ها از دست داده اند. آن ها شامل مواد ژنتیکی هستند که برای بقای جاندار ضروری نیستند. 

تولید انسولین نوترکیب

انسولین هورمونی پپتیدی است که توسط سلولهای بتای پانکرانس تولید شده و مستقیما به خون ترشح می شود. ابتدا هورمون به صورت پری پروانسولین توسط ریبوزوم هایی که بر روی شبکه آندوپلاسمی خشن سلولها قرارگرفته ‌اند ساخته می‌شود. این پیش ساز که دارای 23 اسیدآمینه آبگریز به نام قطعه رهبر است به داخل شبکه آندوپلاسمی هدایت می‌شود. درداخل شبکه این قطعه جدا شده و پیشساز به  "پروانسولین" تبدیل می‌شود. 

ژن های هاوسکیپینگ و کاربرد آنالیز توالی آنها

ژنهای هاوسکیپینگ، ژن هایی هستند که به طور مستمر در اکثر سلول ها بیان می شوند. این ژنها کد کننده پروتئین های دخیل در اعمال حیاتی سلولها می باشند. بسیاری از این پروتئینها، کد کننده آنزیم های شرکت کننده در مسیرهای بیوشیمیایی سلول هستند 

آشنایی با تجهیزات و دستگاه های آزمایشگاه مولکولی و کشت بافت گیاهی (2)

برخی تجهیزات و تکنیک های خاص جهت نگهداری کشت های سلولی مورد نیاز است. در واقع داشتن این امکانات بیشتر به معنای انجام هر چه بهتر فرآیند کشت سلول است. 

ابزارهای مدلسازی و مشاهده نتایج در Systems Biology

چالش بزرگی که در حال حاضر دانشمندان در زیست شناسی سامانه ها (Systems Biology) با آن روبرو هستند، بهره‌برداری از انبوهی از داده ها و اطلاعات در سطوح مختلف سلولی و فرآیندهای رشد و نمو موجودات زنده و ادغام و تحلیل این اطلاعات به منظور درک بهتر برهمکنش سطوح مختلف زیستی می‌باشد.

برای دستیابی به این هدف، باید روش­های ریاضی و کامپیوتری مناسبی برای مدلسازی و شبیه‌سازی سامانه‌های پیچیده زیستی طراحی نمود. بدین ترتیب، به ابزاری مناسب برای استخراج اطلاعاتی کارآمد و مفید از این داده‌های خام که در پایگاه‌های داده‌ها جمع‌آوری و نگهداری می‌شوند، نیاز است. ابزارهای مدلسازی به ما در پروراندن ایده‌های نظری و فرضیات با استفاده از داده‌های خامی که در پایگاه‌های داده‌ها نگهداری می‌شوند، کمک می‌کنند.

در این مبحث چندین ابزار که با بهره­گیری از داده­های خام پایگاه­های علوم زیستی به نمایش، مدلسازی، شبیه­سازی و تحلیل این داده ها و استخراج اطلاعات از آنها کمک می­کنند، معرفی می­گردند. این ابزارها عموماً نرم­افزارها و برنامه­های رایانه­ای می­باشند و عمدتاً از طریق اینترنت قابل تهیه بوده و مرتباً نسخه‌های جدید و بهبود یافته آنها به بازار می‌آید. اغلب این نرم‌افزارها در زمینه یک روش یا فن خاصی بوده و کار کردن با آنها به سهولت انجام می‌شود. 

آشنایی با سیستم بیولوژی (Systems Biology)

در سال­های اخیر، همزمان با توسعه فناوری‌های مختلف زیستی که در مدت زمان کوتاهی داده‌های بسیاری تولید می‌کنند، انبوهی از اطلاعات در سطوح مختلف سلولی و فرآیندهای رشد و نمو موجودات زنده، در اختیار محققان قرار گرفته است. چالش بزرگی که در حال حاضر دانشمندان با آن روبرو هستند، بهره‌برداری از این داده ها و اطلاعات و ادغام آنها به منظور درک بهتر برهمکنش سطوح مختلف زیستی در تشکیل واحدهای عملیاتی مانند مسیرهای هماهنگ کننده، شبکه‌های تنظیمی و ساختارهای پیچیده­تر مثل سلول­ها و بافت­ها می‌باشد. 

بازخوانى داستان کشف مارپیچ دوتایى

در میان یافته‌هاى علمى زیست‌شناسى، به کم‌تر یافته‌اى بر می‌خوردیم که به اندازه‌ى یافته‌ى جیمز واتسون و فرانسیس کریک، یعنى کشف ساختمان سه بعدى DNA معروف باشد. این کشف نتیجه‌ى کار پژوهشى آنان به تنهایى نبود، بلکه حاصل هم‌ اندیشى و کنار هم چیدن یافته‌هاى پژوهشگران دیگرى بود که به باور برخى از دانشمندان، نقش آنان در روشن شدن ساختمان سه بعدى DNA ، از واستون و کریک پررنگ‌تر بود. 

معرفی پایگاه های داده بیوانفورماتیکی (OMIM)

این پایگاه داده را که مربوط به اطلاعات پزشکی است می توان از بین دیتابیس های NCBI باز کرد.