دیدگاه های جدید در مورد سازمان دهی سه بعدی ژنوم و تنوع پذیری ژنتیکی

در حالی که ژنومیک به مطالعه همه ژن ها در سلول یا ارگانیسم می پردازد، اپی ژنومیک مطالعه همه ژنومیک به اضافه تغییراتی است که روی بیان ژن تاثیر می گذارد اما در توالی DNA کد نمی شود.  

به گزارش بنیان به نقل ازmedicalxpress، انواع اطلاعات اپی­ ژنومیکی در مطالعاتی که صورت گرفته منتشر شده است و در دسترس است. این اطلاعات می تواند پایه ارزشمندی برای مطالعه نقش اپی­ژنوم در تکوین و بیماری های انسانی باشد. مطالعات صورت گرفته در دانشگاه کالیفرنیا تفاوت های موجود بین جفت های کروموزومی را نشان داده و بیان کرده که چگونه چین خوردن کروموزوم روی بیان ژن تاثیر می گذارد. تصور می شود که جفت های کروموزومی اغلب مشابه هستند اما این مطالعه طیف وسیعی از تفاوت ها در چگونگی بیان ژن در بین دو کروموزوم را نشان می دهد. این مشالعه نشان می دهد که تفاوت ها در کروموزوم به ارث رسیده از یک والد به والد دیگر بسیار متفاوت است. هم چنین این مطالعه پیشنهاد می کند که این تفاوت ها ریشه در تنوعات توالی های به ارث رسیده دارد و آن ها به صورت تصادفی تقسیم نشده اند. این یافته ها توضیح می دهد که چرا فرزندان یک خانواده همگی(برای مثال) دارای موهایی شبیه پدر و چشم هایی مانند مادر هستند. در بخش دیگر مطالعه این محققین نشان دادند که چگونه ژنوم سازماندهی می شود و چگونه در مواردی مانند تمایز سلول های بنیادی تغییر می یابد. رشته های DNA در هر سلول شدیدا درون کروموزوم های پیچ خورده اند. اما اینکه چگونه ساختار کروموزوم روی بیان ژن تاثیر می گذارد هنوز مشخص نشده است. در این مطالعه رن و تیمش ساختار کروموزومی در سلول های بنیادی و چندین نوع سلول تمایز یافته مشتق از سلول های بنیادی ترسیم کردند. ابتدا، آن ها تمایز را در سلول های بنیادی القا کردند. سپس آن ها از ابزارهای مولکولی برای ارزیابی این که چگونه ساختارهای کروموزوم سلولی تغییر می کند و چگونه این تغییر با فعالیت ژنی مرتبط است، استفاده کردند. آن ها دریافتند که کروموزوم ها به واحدهای ساختاری نسبتا پایداری تقسیم بندی می شوند که آن ها را دومین های مرتبط از نظر توپولوژیک(TADs) می نامند که مرزهای این TAD ها در انواع مختلف سلول های ثابت باقی می ماند. علاوه براین محققین دریافتند که تغییرات درون ساختار کروموزوم اغلب درون TADs اتفاق می افتد که با تغییرات رخ دهنده در اپی­ ژنوم مرتبط است.